MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 34462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015320	ATT	2	6	199160	199165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400141
3502	NC_015320	CAG	2	6	199368	199373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400142
3503	NC_015320	TATT	2	8	199387	199394	25 %	75 %	0 %	0 %	327400142
3504	NC_015320	ACA	2	6	199411	199416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400142
3505	NC_015320	CTT	2	6	199508	199513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400142
3506	NC_015320	GTC	2	6	199587	199592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400142
3507	NC_015320	GTG	2	6	199618	199623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400142
3508	NC_015320	GCTC	2	8	199691	199698	0 %	25 %	25 %	50 %	327400142
3509	NC_015320	CT	3	6	199716	199721	0 %	50 %	0 %	50 %	327400142
3510	NC_015320	CTC	2	6	199723	199728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400142
3511	NC_015320	T	6	6	199729	199734	0 %	100 %	0 %	0 %	327400142
3512	NC_015320	GTA	2	6	199776	199781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400142
3513	NC_015320	AAT	2	6	199887	199892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400142
3514	NC_015320	TC	3	6	199957	199962	0 %	50 %	0 %	50 %	327400142
3515	NC_015320	AAG	2	6	199987	199992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400142
3516	NC_015320	CACG	2	8	200097	200104	25 %	0 %	25 %	50 %	327400142
3517	NC_015320	CA	3	6	200131	200136	50 %	0 %	0 %	50 %	327400142
3518	NC_015320	AAG	2	6	200172	200177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400142
3519	NC_015320	ACT	2	6	200212	200217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400142
3520	NC_015320	TA	3	6	200256	200261	50 %	50 %	0 %	0 %	327400142
3521	NC_015320	CT	3	6	200286	200291	0 %	50 %	0 %	50 %	327400142
3522	NC_015320	G	6	6	200300	200305	0 %	0 %	100 %	0 %	327400142
3523	NC_015320	T	6	6	200311	200316	0 %	100 %	0 %	0 %	327400142
3524	NC_015320	AGC	2	6	200386	200391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400142
3525	NC_015320	GTA	2	6	200542	200547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400143
3526	NC_015320	AACG	2	8	200566	200573	50 %	0 %	25 %	25 %	327400143
3527	NC_015320	TGA	2	6	200583	200588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400143
3528	NC_015320	GCA	2	6	200696	200701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400143
3529	NC_015320	ATT	2	6	200864	200869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400143
3530	NC_015320	TC	3	6	200910	200915	0 %	50 %	0 %	50 %	327400143
3531	NC_015320	ATG	2	6	201050	201055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400143
3532	NC_015320	TGC	2	6	201084	201089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400143
3533	NC_015320	GCAG	2	8	201128	201135	25 %	0 %	50 %	25 %	327400143
3534	NC_015320	ATG	2	6	201236	201241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400143
3535	NC_015320	GAA	2	6	201250	201255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400143
3536	NC_015320	AAAC	2	8	201455	201462	75 %	0 %	0 %	25 %	327400144
3537	NC_015320	GTA	2	6	201594	201599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400144
3538	NC_015320	CGA	2	6	201759	201764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400144
3539	NC_015320	CAA	2	6	201833	201838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400144
3540	NC_015320	CAG	2	6	201864	201869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400144
3541	NC_015320	TCTGT	2	10	201964	201973	0 %	60 %	20 %	20 %	327400144
3542	NC_015320	GGAG	2	8	201980	201987	25 %	0 %	75 %	0 %	327400144
3543	NC_015320	AAT	2	6	201989	201994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400144
3544	NC_015320	AATC	2	8	202017	202024	50 %	25 %	0 %	25 %	327400144
3545	NC_015320	GTT	2	6	202193	202198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400145
3546	NC_015320	GT	3	6	202312	202317	0 %	50 %	50 %	0 %	327400145
3547	NC_015320	ATGT	2	8	202320	202327	25 %	50 %	25 %	0 %	327400145
3548	NC_015320	A	6	6	202441	202446	100 %	0 %	0 %	0 %	327400146
3549	NC_015320	TTC	2	6	202468	202473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400146
3550	NC_015320	AAG	2	6	202474	202479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400146
3551	NC_015320	TA	3	6	202497	202502	50 %	50 %	0 %	0 %	327400146
3552	NC_015320	GAC	2	6	202524	202529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3553	NC_015320	GACTG	2	10	202552	202561	20 %	20 %	40 %	20 %	327400146
3554	NC_015320	ACGAG	2	10	202595	202604	40 %	0 %	40 %	20 %	327400146
3555	NC_015320	AG	3	6	202618	202623	50 %	0 %	50 %	0 %	327400146
3556	NC_015320	CGA	2	6	202688	202693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3557	NC_015320	GGA	3	9	202731	202739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400146
3558	NC_015320	CGA	2	6	202797	202802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3559	NC_015320	TGC	2	6	202814	202819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3560	NC_015320	CAA	2	6	202914	202919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400146
3561	NC_015320	GCA	2	6	202968	202973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3562	NC_015320	CGT	2	6	202977	202982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400146
3563	NC_015320	GAT	2	6	203134	203139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400147
3564	NC_015320	CGA	2	6	203143	203148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400147
3565	NC_015320	GGA	3	9	203194	203202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400147
3566	NC_015320	GATC	2	8	203233	203240	25 %	25 %	25 %	25 %	327400147
3567	NC_015320	AAGG	2	8	203322	203329	50 %	0 %	50 %	0 %	327400147
3568	NC_015320	AG	3	6	203373	203378	50 %	0 %	50 %	0 %	327400147
3569	NC_015320	AAC	2	6	203515	203520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400148
3570	NC_015320	GAAG	2	8	203538	203545	50 %	0 %	50 %	0 %	327400148
3571	NC_015320	AGG	2	6	203561	203566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400148
3572	NC_015320	GAA	3	9	203572	203580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400148
3573	NC_015320	AG	3	6	203607	203612	50 %	0 %	50 %	0 %	327400148
3574	NC_015320	AGG	2	6	203693	203698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400148
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3577	NC_015320	ATT	2	6	203844	203849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400149
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3580	NC_015320	GAA	2	6	204031	204036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400150
3581	NC_015320	TCG	2	6	204059	204064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400150
3582	NC_015320	GAT	2	6	204133	204138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400150
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3584	NC_015320	GGAA	2	8	204236	204243	50 %	0 %	50 %	0 %	327400150
3585	NC_015320	TGG	2	6	204264	204269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400150
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3587	NC_015320	A	6	6	204400	204405	100 %	0 %	0 %	0 %	327400150
3588	NC_015320	ATTC	2	8	204495	204502	25 %	50 %	0 %	25 %	327400150
3589	NC_015320	GGT	2	6	204590	204595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400150
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3591	NC_015320	AAC	2	6	204747	204752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400150
3592	NC_015320	ATA	2	6	204880	204885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400150
3593	NC_015320	TTTC	2	8	204926	204933	0 %	75 %	0 %	25 %	327400151
3594	NC_015320	TC	3	6	204976	204981	0 %	50 %	0 %	50 %	327400151
3595	NC_015320	GTA	2	6	204992	204997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400151
3596	NC_015320	TC	3	6	205034	205039	0 %	50 %	0 %	50 %	327400151
3597	NC_015320	TGCC	2	8	205099	205106	0 %	25 %	25 %	50 %	327400151
3598	NC_015320	AAG	2	6	205158	205163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400151
3599	NC_015320	CCAC	2	8	205222	205229	25 %	0 %	0 %	75 %	327400151
3600	NC_015320	TCTA	2	8	205244	205251	25 %	50 %	0 %	25 %	327400151
3601	NC_015320	CTT	2	6	205264	205269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400151
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3604	NC_015320	GATT	2	8	205444	205451	25 %	50 %	25 %	0 %	327400151
3605	NC_015320	TCA	2	6	205530	205535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400151
3606	NC_015320	TCT	2	6	205551	205556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3607	NC_015320	AGC	2	6	205582	205587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400152
3608	NC_015320	TCG	3	9	205680	205688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400152
3609	NC_015320	TTC	2	6	205741	205746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3610	NC_015320	CTT	2	6	205852	205857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3611	NC_015320	CAGG	2	8	205977	205984	25 %	0 %	50 %	25 %	327400152
3612	NC_015320	TTG	2	6	206006	206011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400152
3613	NC_015320	TGA	2	6	206015	206020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400152
3614	NC_015320	CTTC	2	8	206061	206068	0 %	50 %	0 %	50 %	327400152
3615	NC_015320	ATC	2	6	206107	206112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400152
3616	NC_015320	TTCA	2	8	206125	206132	25 %	50 %	0 %	25 %	327400152
3617	NC_015320	CTT	2	6	206205	206210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3618	NC_015320	GCCT	2	8	206243	206250	0 %	25 %	25 %	50 %	327400152
3619	NC_015320	TCA	2	6	206253	206258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400152
3620	NC_015320	CGG	2	6	206263	206268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327400152
3621	NC_015320	ATC	2	6	206557	206562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400152
3622	NC_015320	CTT	2	6	206635	206640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3623	NC_015320	TCC	2	6	206645	206650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400152
3624	NC_015320	TCT	2	6	206676	206681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400152
3625	NC_015320	CT	3	6	206703	206708	0 %	50 %	0 %	50 %	327400152
3626	NC_015320	T	6	6	206723	206728	0 %	100 %	0 %	0 %	327400152
3627	NC_015320	TTTC	2	8	206747	206754	0 %	75 %	0 %	25 %	327400152
3628	NC_015320	TTG	2	6	206765	206770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400152
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3663	NC_015320	GAT	2	6	208786	208791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400154
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3733	NC_015320	GAC	2	6	212062	212067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400156
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3739	NC_015320	G	6	6	212258	212263	0 %	0 %	100 %	0 %	327400156
3740	NC_015320	CTT	2	6	212325	212330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400156
3741	NC_015320	AT	3	6	212505	212510	50 %	50 %	0 %	0 %	327400157
3742	NC_015320	ATG	2	6	212553	212558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400157
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3744	NC_015320	TGC	2	6	212729	212734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400157
3745	NC_015320	CCA	2	6	212756	212761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400157
3746	NC_015320	TGGTA	2	10	212857	212866	20 %	40 %	40 %	0 %	327400157
3747	NC_015320	TCA	2	6	212944	212949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400157
3748	NC_015320	CGG	2	6	213026	213031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327400157
3749	NC_015320	TCG	2	6	213037	213042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400157
3750	NC_015320	CTG	2	6	213053	213058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400157
3751	NC_015320	TCC	2	6	213142	213147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400157
3752	NC_015320	CTG	2	6	213206	213211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400157
3753	NC_015320	ATT	2	6	213247	213252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400157
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3755	NC_015320	TCG	2	6	213474	213479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400158
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3760	NC_015320	AGA	2	6	213607	213612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400158
3761	NC_015320	GAA	2	6	213637	213642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400158
3762	NC_015320	TAA	2	6	213667	213672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400158
3763	NC_015320	CTG	2	6	213738	213743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400158
3764	NC_015320	TTC	2	6	213816	213821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400158
3765	NC_015320	GA	3	6	213884	213889	50 %	0 %	50 %	0 %	327400158
3766	NC_015320	ATTGAG	2	12	213921	213932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400158
3767	NC_015320	AATAAG	2	12	213956	213967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327400158
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3769	NC_015320	ATC	2	6	214023	214028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400159
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3773	NC_015320	TAC	2	6	214174	214179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400159
3774	NC_015320	ACT	2	6	214284	214289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400159
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3777	NC_015320	TTC	2	6	214447	214452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400159
3778	NC_015320	AC	3	6	214493	214498	50 %	0 %	0 %	50 %	327400159
3779	NC_015320	CCA	3	9	214535	214543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400159
3780	NC_015320	ACAG	2	8	214880	214887	50 %	0 %	25 %	25 %	327400160
3781	NC_015320	CAAA	2	8	214910	214917	75 %	0 %	0 %	25 %	327400160
3782	NC_015320	CCT	2	6	214944	214949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400160
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3786	NC_015320	TTGC	2	8	215099	215106	0 %	50 %	25 %	25 %	327400160
3787	NC_015320	AC	3	6	215123	215128	50 %	0 %	0 %	50 %	327400160
3788	NC_015320	CAGCT	2	10	215197	215206	20 %	20 %	20 %	40 %	327400160
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3800	NC_015320	CTG	2	6	215662	215667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400161
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3804	NC_015320	CTTTTA	2	12	215872	215883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327400161
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3822	NC_015320	CGAC	2	8	216891	216898	25 %	0 %	25 %	50 %	327400162
3823	NC_015320	TTG	2	6	216972	216977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400162
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3832	NC_015320	TTA	2	6	217296	217301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400162
3833	NC_015320	T	6	6	217433	217438	0 %	100 %	0 %	0 %	327400163
3834	NC_015320	GGT	2	6	217478	217483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400163
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3840	NC_015320	CTG	2	6	218091	218096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400164
3841	NC_015320	CTG	2	6	218116	218121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400164
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3844	NC_015320	CAGT	2	8	218281	218288	25 %	25 %	25 %	25 %	327400164
3845	NC_015320	CAT	3	9	218360	218368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400164
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3847	NC_015320	TGTTGG	2	12	218483	218494	0 %	50 %	50 %	0 %	327400164
3848	NC_015320	GT	3	6	218590	218595	0 %	50 %	50 %	0 %	327400165
3849	NC_015320	A	6	6	218627	218632	100 %	0 %	0 %	0 %	327400165
3850	NC_015320	GAC	2	6	218696	218701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400165
3851	NC_015320	CAAC	2	8	218730	218737	50 %	0 %	0 %	50 %	327400165
3852	NC_015320	GAA	2	6	218829	218834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400165
3853	NC_015320	TGA	2	6	218894	218899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400165
3854	NC_015320	TC	3	6	218903	218908	0 %	50 %	0 %	50 %	327400165
3855	NC_015320	A	6	6	218931	218936	100 %	0 %	0 %	0 %	327400165
3856	NC_015320	TGGAT	2	10	219032	219041	20 %	40 %	40 %	0 %	327400165
3857	NC_015320	TGA	2	6	219134	219139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400165
3858	NC_015320	TCA	2	6	219160	219165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400165
3859	NC_015320	AAT	2	6	219240	219245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400165
3860	NC_015320	GTGG	2	8	219302	219309	0 %	25 %	75 %	0 %	327400165
3861	NC_015320	AGG	2	6	219424	219429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400165
3862	NC_015320	TTA	2	6	219456	219461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400166
3863	NC_015320	GAT	2	6	219479	219484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400166
3864	NC_015320	TTCT	2	8	219503	219510	0 %	75 %	0 %	25 %	327400166
3865	NC_015320	TGGC	2	8	219639	219646	0 %	25 %	50 %	25 %	327400166
3866	NC_015320	AGT	2	6	219677	219682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400166
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3989	NC_015320	AAT	2	6	226074	226079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400174
3990	NC_015320	AAAAT	2	10	226142	226151	80 %	20 %	0 %	0 %	327400174
3991	NC_015320	A	6	6	226221	226226	100 %	0 %	0 %	0 %	327400174
3992	NC_015320	TAA	2	6	226335	226340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400174
3993	NC_015320	TA	3	6	226363	226368	50 %	50 %	0 %	0 %	327400174
3994	NC_015320	AC	3	6	226375	226380	50 %	0 %	0 %	50 %	327400174
3995	NC_015320	ACT	2	6	226410	226415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400174
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3997	NC_015320	TCT	2	6	226486	226491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400174
3998	NC_015320	AGAGGG	2	12	226494	226505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400174
3999	NC_015320	A	6	6	226564	226569	100 %	0 %	0 %	0 %	327400174
4000	NC_015320	ACA	2	6	226603	226608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400174

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